الکتروفروزیس یک تکنیک آزمایشگاهی است که برای جداسازی مولکول‌ها بر اساس اندازه، شکل و بار الکتریکی آن‌ها استفاده می‌شود. در الکتروفروزیس، یک میدان الکتریکی به یک ژل یا محلول حاوی مولکول‌های مورد نظر اعمال می‌شود که باعث حرکت آن‌ها به سمت الکترود با بار مخالف می‌شود.

ژل الکتروفروزیس، که بیشترین استفاده را دارد، در آن نمونه بر روی یک ماتریس ژل قرار می‌گیرد و میدان الکتریکی به ژل اعمال می‌شود. مولکول‌ها با سرعت‌های مختلف از طریق ژل حرکت کرده و بر اساس اندازه و شکل آن‌ها جداسازی می‌شوند. این باعث ایجاد باندهای مشخص یا “پهنه‌ها” روی ژل می‌شود که با استفاده از رنگ‌ها و روش‌های تشخیص دیگر قابل مشاهده هستند